Fakültemiz, Yüksek Sağlık Şurasının 23.05.1995 tarih ve 185/1 sayılı kararı doğrultusunda, Sağlık Bakanlığına bağlı Sağlık Meslek Liselerinin öğrenci alımının durdurulması ve yerine Sağlık Yüksekokullarının açılmasına ilişkin politikaya uygun olarak kurulmuştur. Bu kapsamda, Sağlık Bakanlığı ve Yükseköğretim Kurulu (YÖK) arasında 22.11.1996 tarihinde imzalanan protokole dayanarak, 1996-1997 eğitim-öğretim yılında Ebelik ve Hemşirelik Bölümleri ile eğitim faaliyetlerine başlamıştır. Açılışı takip eden yıl öğrenci alımı yapılmamış, öğretim elemanı kadrosunun tamamlanmasının ardından 1998-1999 eğitim-öğretim yılında Metropol binasının 13. katında öğretime devam edilmiştir.

Fakültemiz, 1999-2000 eğitim-öğretim yılı itibarıyla Yenişehir Kampüsü B Blokta, 2010-2011 eğitim-öğretim yılından itibaren ise Çiftlikköy Kampüsü'nde faaliyetlerini sürdürmüştür. Akademik yapımız, 2010 yılında Sağlık Kurumları İşletmeciliği ve Sosyal Hizmetler, 2016 yılında ise Beslenme ve Diyetetik Bölümleri'nin eklenmesiyle genişlemiştir. Son olarak, 28 Haziran 2024 tarihli ve 32586 sayılı Resmî Gazete'de yayımlanan 27 Haziran 2024 tarihli ve 8653 sayılı Cumhurbaşkanı kararı ile yüksekokulumuzun statüsü değiştirilerek, Sağlık Bilimleri Fakültesi adıyla faaliyetlerine devam etme kararı alınmıştır.